More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0436 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0436  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257005  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  56.07 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  57.84 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  60.64 
 
 		 96 aa  107  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  52.69 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  53.76 
 
 		 100 aa  97.1  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  54 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  53.12 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  48.57 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  49.48 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  47.71 
 
 		 112 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  47.71 
 
 		 112 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  48.25 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  43.12 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  43 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  61.43 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  61.43 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  44.33 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  61.43 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  46 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  54.32 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  55.41 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  45.37 
 
 		 191 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  45 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  44 
 
 		 100 aa  84  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  44.68 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  42.73 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  47 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  45.1 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  45.37 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  45.1 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  45.1 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  37.76 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  42 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  39.29 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  38 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  42 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  42 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  45 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  44.68 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  44.12 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  47.13 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  44.12 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  57.75 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  41.96 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  57.75 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  41.84 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  53.33 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  43.88 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  43.64 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  41.07 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  41.35 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  43 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  38 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  41.07 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  42.57 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  42.57 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  44.44 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  40 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  41.41 
 
 		 105 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  41 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  41.07 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  42 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  43.88 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  41 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  41 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  40.4 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  47.73 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1999  hypothetical protein  47 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  45 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  40.18 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>