89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4829 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  100 
 
 		 142 aa  285  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0116535  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0505  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  43.09 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0846  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.65 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303881  normal  0.0908937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4252  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.72 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0365  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.94 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0234579  hitchhiker  0.00208222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  42.42 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0641507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.12 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.277304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0969  hypothetical protein  33.6 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.75 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0268055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1623  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.11 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6087  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.68 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.116644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0550  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.33 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0267211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4056  PPOX class putative F420-dependent enzyme  31.82 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0149029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4464  putative F420-dependent enzyme  30.71 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  31.82 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6357  PPOX class putative F420-dependent enzyme  35.79 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  32.2 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2083  putative F420-dependent enzyme  30 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1056  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  27.78 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.991641  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2318  hypothetical protein  30.53 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.238988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1362  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.57 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0924624  normal  0.216406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0730  PPOX class putative F420-dependent enzyme  31.25 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2143  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.23 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.14 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.574434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1618  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.14 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal  0.71127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1545  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.14 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.14 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0190742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.14 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0832  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related protein FMN-binding  33.33 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal  0.753122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5602  hypothetical protein  33.83 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0370067  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.63 
 
 		 231 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1561  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01598  hypothetical protein  35.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2002  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000269962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1714  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  35.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1040  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related protein FMN-binding  35.19 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.239296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.78 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.13615  normal  0.054118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2060  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.78 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1810  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.86 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00431301  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.86 
 
 		 229 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1830  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.29 
 
 		 218 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.29 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000320957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2378  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.35 
 
 		 227 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1702  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.99 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.76 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182808  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420266  normal  0.0379481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985992  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7022  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  39.13 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.86 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7841  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1649  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.92 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1772  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.92 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.382068  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0488  PPOX class putative F420-dependent enzyme  28.23 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2662  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  33.33 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000998111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1626  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.86 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0502858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1807  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1770  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3982  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.78 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0720616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.43 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1763  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1141  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.2 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2515  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.43 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.961854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2112  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.56 
 
 		 129 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  33.82 
 
 		 211 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2277  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.99 
 
 		 212 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.19 
 
 		 159 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2477  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.43 
 
 		 212 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00062859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.130607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2662  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.88 
 
 		 227 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0604494  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.92 
 
 		 240 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.43 
 
 		 232 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2606  pyridoxal 5'-phosphate synthase  34.78 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07092  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.88 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32.86 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1343  PPOX class putative F420-dependent enzyme  30.1 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3010  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3832  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  25.71 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.954324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1779  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0691988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1732  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  31 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.455039  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1711  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4137  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related protein FMN-binding  32.31 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.428154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3416  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  36.99 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.681165  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.78 
 
 		 155 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119424  normal  0.155123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>