More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3990 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3990  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0013  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  53.37 
 
 
328 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0388317  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  48.77 
 
 
328 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0747083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5340  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  51.86 
 
 
326 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1990  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.84 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527642  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4086  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
325 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  45.65 
 
 
312 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  hitchhiker  0.000464332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2021  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.07 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000187995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.39 
 
 
323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.08 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3278  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.94 
 
 
331 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
323 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2263  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.74 
 
 
324 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1703  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.72 
 
 
318 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.65 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.31 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.95 
 
 
320 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.47 
 
 
320 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
328 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
328 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0197  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
327 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.64 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  35.35 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2841  alcohol dehydrogenase  36.92 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  33.33 
 
 
328 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.67 
 
 
324 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.03 
 
 
328 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4153  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
316 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  34.04 
 
 
325 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  33.92 
 
 
325 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.54 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
324 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  32.73 
 
 
328 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.03 
 
 
328 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  33.43 
 
 
325 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.7 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.485506  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  32.73 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  34.71 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
325 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.09 
 
 
324 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.14 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5249  quinone oxidoreductase  38.89 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.03 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.28 
 
 
323 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.35 
 
 
361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3398  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1526  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.28 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.04 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
325 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.33 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.95 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.5 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.15 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.36 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  33.03 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  30.84 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.15 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.54 
 
 
325 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  31.44 
 
 
324 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.25 
 
 
328 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  32.52 
 
 
308 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.28 
 
 
323 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 
326 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  33.03 
 
 
324 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.78 
 
 
322 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
333 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
325 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
324 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
324 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.52 
 
 
328 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0059  alcohol dehydrogenase  35.27 
 
 
325 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
326 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
327 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
327 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 
326 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 
326 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.91 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.86 
 
 
328 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  33.53 
 
 
322 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  33.04 
 
 
324 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.42 
 
 
324 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5520  putative dehydrogenase/oxidoreductase  35.98 
 
 
313 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566328  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.82 
 
 
323 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.34 
 
 
326 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  32.74 
 
 
331 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
325 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.65 
 
 
331 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
326 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
324 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>