More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2624 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2624  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  256  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0424  IstB domain protein ATP-binding protein  74.12 
 
 
263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2531  IstB domain protein ATP-binding protein  74.12 
 
 
263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000490561  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3657  IstB domain protein ATP-binding protein  74.12 
 
 
263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.32372  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4518  IstB domain protein ATP-binding protein  74.12 
 
 
263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3669  IstB domain protein ATP-binding protein  75 
 
 
263 aa  116  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1779  IstB ATP binding domain-containing protein  78.38 
 
 
271 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.330119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  78.38 
 
 
272 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0459  IstB ATP binding domain-containing protein  78.38 
 
 
272 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.498177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  74.32 
 
 
259 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  74.32 
 
 
259 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  74.32 
 
 
259 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  74.32 
 
 
274 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  74.32 
 
 
274 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  74.32 
 
 
274 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  74.32 
 
 
274 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  60.87 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  49.4 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  49.4 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  49.4 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  38.27 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  38.27 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2678  IstB domain protein ATP-binding protein  44.12 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.450987  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  44.12 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  44.12 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0484  IstB-like ATP-binding protein  35.87 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3364  IstB-like ATP-binding protein  35.87 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  47.3 
 
 
255 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  42.17 
 
 
248 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  40.96 
 
 
250 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0129  transposase  40.58 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3164  IstB ATP binding domain-containing protein  39.19 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  43.04 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0418  IstB-like ATP-binding protein  41.79 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176117  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1250  IstB-like ATP-binding protein  41.79 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125025  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3051  IstB ATP binding domain-containing protein  41.27 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2071  IstB-like ATP-binding protein  43.94 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.941019  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5322  IstB-like ATP-binding protein  41.79 
 
 
275 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2407  IstB domain protein ATP-binding protein  40.3 
 
 
265 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3172  IstB domain protein ATP-binding protein  40.3 
 
 
265 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  40.3 
 
 
265 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  34.94 
 
 
272 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  34.94 
 
 
272 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  34.94 
 
 
272 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0154  transposition protein IstB for insertion sequence IS1326  36.11 
 
 
260 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1581  transposon NTP-binding protein  36.11 
 
 
261 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0465434  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  38.67 
 
 
268 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4202  IstB-like ATP-binding protein  38.24 
 
 
277 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  38.67 
 
 
277 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  38.67 
 
 
277 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3303  putative transposase  38.67 
 
 
253 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0674  IstB domain protein ATP-binding protein  42.65 
 
 
256 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109995  hitchhiker  0.00130899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2557  IstB-like ATP-binding protein  43.33 
 
 
265 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2900  IstB-like ATP-binding protein  43.33 
 
 
265 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4867  IstB-like ATP-binding protein  43.33 
 
 
265 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4955  IstB-like ATP-binding protein  43.33 
 
 
265 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0005  IstB ATP binding domain-containing protein  43.33 
 
 
265 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3205  IstB ATP binding domain-containing protein  43.33 
 
 
265 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3298  IstB ATP binding domain-containing protein  43.33 
 
 
265 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0314  IstB domain protein ATP-binding protein  42.65 
 
 
256 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.198752  normal  0.0610024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1721  IstB domain protein ATP-binding protein  42.65 
 
 
256 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1594  IstB domain protein ATP-binding protein  42.65 
 
 
256 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.366268  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5104  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
242 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34332 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1677  IstB domain protein ATP-binding protein  42.65 
 
 
256 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0071  putative insertion sequence ATP-binding protein  37.33 
 
 
269 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4454  putative DNA replication protein  37.33 
 
 
269 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399205  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  38.89 
 
 
242 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  38.89 
 
 
242 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3496  transposase  38.24 
 
 
270 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.316856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0942  transposase  38.24 
 
 
270 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0891094  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1831  transposase  38.24 
 
 
270 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0314  transposase  38.24 
 
 
270 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  36.99 
 
 
245 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0738  IstB ATP binding domain-containing protein  37.97 
 
 
273 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0830  IstB ATP binding domain-containing protein  37.97 
 
 
273 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1215  IstB ATP binding domain-containing protein  37.97 
 
 
273 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3098  IstB ATP binding domain-containing protein  37.97 
 
 
273 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.568531  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0432  IstB-like ATP-binding protein  37.5 
 
 
242 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0234924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0849  IstB-like ATP-binding protein  37.5 
 
 
242 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.152009  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
242 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.938722  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5131  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
242 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701045  normal  0.85319 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4981  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
242 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0909  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
242 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3391  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
242 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
242 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3052  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
242 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043848 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2134  IstB ATP binding domain-containing protein  38.24 
 
 
103 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  35.64 
 
 
268 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3066  IstB domain protein ATP-binding protein  41.18 
 
 
251 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1787  putative transposase-associated ATP- binding protein  39.34 
 
 
280 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  42.67 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  42.67 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  42.67 
 
 
266 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1108  IstB domain protein ATP-binding protein  36.11 
 
 
242 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  34.09 
 
 
277 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  34.09 
 
 
277 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3402  IS21 family transposase  41.67 
 
 
264 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3045  IS21 family transposase  41.67 
 
 
264 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>