29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2591 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  100 
 
 
163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  91.72 
 
 
148 aa  216  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  43.61 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  35 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  38.35 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  46.88 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  44.44 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  33.33 
 
 
137 aa  61.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  39.39 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  34.85 
 
 
152 aa  54.7  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3329  hypothetical protein  33.01 
 
 
367 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  31.25 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  39.13 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0222  TadE family protein  28.57 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1311  hypothetical protein  36 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  32.08 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  32.08 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  32.08 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  32.08 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  32.08 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  32.08 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  31.13 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1240  TadE family protein  33.1 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  40.35 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  32.76 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  35.71 
 
 
126 aa  41.2  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  31.76 
 
 
186 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  32 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  24.58 
 
 
129 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>