15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1311 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1311  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  346  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  38.1 
 
 		 155 aa  92  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  39.69 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  38.46 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  31.93 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  28.24 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  35.77 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0222  TadE family protein  38.64 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  37.78 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3329  hypothetical protein  30.95 
 
 		 367 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  35 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0051  TadE family protein  34.78 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.818933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  33.81 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  37.12 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2221  TadE family protein  37.29 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.324888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>