13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1546 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  52.59 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  35.11 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  40 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  38.97 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  33.58 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  35.82 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  37.78 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  35.24 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  34.62 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  36.5 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  42.62 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1311  hypothetical protein  37.8 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.419833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>