17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6889 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  100 
 
 		 153 aa  290  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  41.04 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  45.14 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  47.29 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  48.51 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  44.44 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  40 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  35.95 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  38.89 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  50 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  37.04 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  38.85 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1311  hypothetical protein  35.71 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 367 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  35.37 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8208  TadE family protein  33.58 
 
 		 240 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  32.74 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>