17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1228 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  100 
 
 		 144 aa  276  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  36.43 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  41.38 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  44.44 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  36.36 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  46.88 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  45.8 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  38.85 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  39.57 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  39.85 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  38.85 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3329  hypothetical protein  34.62 
 
 		 367 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20370  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  34.87 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3424  TadE family protein  41.35 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  42.64 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  34.67 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>