34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2227 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  51.85 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3424  TadE family protein  48.94 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  42.95 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  40.27 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  35.04 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  39.13 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  36.3 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0676  TadE family protein  46.67 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  36.69 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  40.43 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  34.78 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  39.85 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  42.19 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  36.99 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  34.29 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  47.46 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2304  TadE family protein  34.78 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2294  TadE family protein  34.78 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  43.84 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  43.84 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  43.84 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  43.84 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  43.84 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  43.84 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3129  TadE family protein  50 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  45 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  35.48 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  45.16 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.83 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.83 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.83 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  29.56 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  37.04 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>