17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0676 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0676  TadE family protein  100 
 
 		 141 aa  269  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  45.93 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  46.67 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  45.33 
 
 		 186 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  46 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3424  TadE family protein  49.63 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  37.59 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  42.42 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  37.04 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  40.6 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  37.04 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  37.23 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  43.28 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3329  hypothetical protein  35.34 
 
 		 367 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  39.26 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3129  TadE family protein  52.63 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  40.3 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>