13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3129 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3129  TadE family protein  100 
 
 
140 aa  269  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  33.33 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  34.93 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  35.29 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3329  hypothetical protein  34.34 
 
 
367 aa  47.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  36.92 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  36.76 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  34 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  32.26 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  31.82 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  29.63 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  35.59 
 
 
160 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  39.58 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>