13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4452 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  90 
 
 		 153 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  41.98 
 
 		 147 aa  94.7  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  42.95 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  29.49 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0676  TadE family protein  45.33 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3424  TadE family protein  40.67 
 
 		 141 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  34.87 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  41.61 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  31.76 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  37.88 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  34.64 
 
 		 148 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  35.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>