27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1732 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  100 
 
 		 148 aa  285  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  91.72 
 
 		 163 aa  216  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  44.36 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  37.5 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  47.29 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  38.35 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  45.8 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  40.94 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  32.82 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  36.3 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3329  hypothetical protein  31.25 
 
 		 367 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  31.25 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  33.02 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  33.02 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  33.02 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  33.02 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  33.02 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  33.02 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1311  hypothetical protein  37.01 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  32.08 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  37.68 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0222  TadE family protein  27.56 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  42.11 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  27.12 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  34 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  36.45 
 
 		 126 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  34.69 
 
 		 153 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>