18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4137 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  100 
 
 
155 aa  308  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4649  TadE family protein  39.72 
 
 
176 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  35.11 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1311  hypothetical protein  37.9 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  40.14 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  37.32 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6889  TadE family protein  41.04 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  0.715699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1732  TadE-like  37.62 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00355275  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2591  TadE family protein  36.63 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1228  TadE family protein  36.43 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0837  TadE family protein  34.59 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0168939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2227  TadE family protein  34.56 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4965  TadE family protein  31.37 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3329  hypothetical protein  32 
 
 
367 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0259928  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2757  TadE family protein  50 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00105731  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4452  TadE family protein  29.49 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1240  TadE family protein  34.69 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8208  TadE family protein  38.58 
 
 
240 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>