10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8208 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8208  TadE family protein  100 
 
 		 240 aa  470  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  37.68 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4037  TadE family protein  33.12 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.460522  normal  0.0160296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1546  TadE family protein  37.88 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  32.71 
 
 		 170 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25260  TadE-like protein  37.38 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4721  TadE family protein  31.21 
 
 		 160 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0626719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  30.77 
 
 		 157 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  38.98 
 
 		 142 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  38.98 
 
 		 142 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>