16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1240 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1240  TadE family protein  100 
 
 
175 aa  327  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1028  TadE family protein  56.74 
 
 
156 aa  121  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3785  TadE family protein  56.2 
 
 
148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531026  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20370  hypothetical protein  43.06 
 
 
155 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2668  hypothetical protein  49.09 
 
 
168 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2403  hypothetical protein  43.36 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0530883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5821  hypothetical protein  38.56 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.737564  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2786  TadE family protein  51.85 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.960763  hitchhiker  0.0024557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0784  hypothetical protein  38.95 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0861  TadE family protein  39.82 
 
 
145 aa  62.4  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1646  hypothetical protein  35.48 
 
 
163 aa  60.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142608  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1734  hypothetical protein  36.65 
 
 
203 aa  58.9  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1214  hypothetical protein  37.68 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07550  hypothetical protein  43.97 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4137  TadE family protein  33.54 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10370  hypothetical protein  35.17 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>