14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0784 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0784  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5821  hypothetical protein  82.12 
 
 		 169 aa  244  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.737564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1646  hypothetical protein  43.15 
 
 		 163 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142608  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1240  TadE family protein  38.93 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1734  hypothetical protein  43.05 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20370  hypothetical protein  32.19 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1214  hypothetical protein  41.1 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0861  TadE family protein  40.65 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2668  hypothetical protein  30.77 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1028  TadE family protein  40.82 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07550  hypothetical protein  40.65 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3785  TadE family protein  37.97 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531026  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2403  hypothetical protein  32.58 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0530883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1257  hypothetical protein  47.42 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>