13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1214 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  302  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5821  hypothetical protein  45 
 
 		 169 aa  84  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.737564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1646  hypothetical protein  37.23 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142608  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0784  hypothetical protein  42.18 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2668  hypothetical protein  38.1 
 
 		 168 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1240  TadE family protein  39.84 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2403  hypothetical protein  35.71 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0530883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3785  TadE family protein  36.59 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531026  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20370  hypothetical protein  32.91 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1028  TadE family protein  45.28 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07550  hypothetical protein  40.32 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1257  hypothetical protein  45.67 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109609  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1734  hypothetical protein  35.66 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>