15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20370  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1240  TadE family protein  43.57 
 
 
175 aa  103  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3785  TadE family protein  44.04 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531026  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1028  TadE family protein  45 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2668  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2403  hypothetical protein  35.43 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0530883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0784  hypothetical protein  32.19 
 
 
202 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5821  hypothetical protein  30.34 
 
 
169 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.737564  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1646  hypothetical protein  31.62 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142608  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10370  hypothetical protein  34.27 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129206  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0861  TadE family protein  36.45 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2786  TadE family protein  42.34 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.960763  hitchhiker  0.0024557 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1734  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07550  hypothetical protein  39.37 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1214  hypothetical protein  32.95 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>