15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1028 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1028  TadE family protein  100 
 
 
156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1240  TadE family protein  55.94 
 
 
175 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3785  TadE family protein  50.7 
 
 
148 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531026  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2668  hypothetical protein  45.69 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20370  hypothetical protein  45 
 
 
155 aa  93.6  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2403  hypothetical protein  45.76 
 
 
173 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0530883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2786  TadE family protein  51.75 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.960763  hitchhiker  0.0024557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5821  hypothetical protein  35.48 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.737564  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0784  hypothetical protein  40.82 
 
 
202 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1734  hypothetical protein  41.43 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1646  hypothetical protein  41.35 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142608  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0861  TadE family protein  38.98 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07550  hypothetical protein  37.59 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0051  TadE family protein  34.88 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.818933  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1214  hypothetical protein  45.28 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>