86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2249 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2249  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 		 64 aa  126  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0176531  decreased coverage  0.00631753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1914  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  75 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11607  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6395  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  48.08 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.816862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1548  molybdopterin oxidoreductase  39.34 
 
 		 1000 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118876  normal  0.471457 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  50.94 
 
 		 879 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  37.04 
 
 		 883 aa  50.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  39.58 
 
 		 899 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  48 
 
 		 892 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1766  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42.59 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0091  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  38.71 
 
 		 633 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5033  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.354323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  42.59 
 
 		 895 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1323  molybdopterin oxidoreductase  41.18 
 
 		 1094 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  36.36 
 
 		 967 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.22 
 
 		 306 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.35 
 
 		 895 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  47.92 
 
 		 897 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  40.74 
 
 		 895 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.51 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.33 
 
 		 296 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.6 
 
 		 286 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  34.69 
 
 		 905 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  40.38 
 
 		 1180 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  29.63 
 
 		 915 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2321  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42 
 
 		 835 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.5 
 
 		 904 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.51 
 
 		 280 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.1 
 
 		 309 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.62 
 
 		 284 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.86 
 
 		 291 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  33.93 
 
 		 1188 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.48 
 
 		 846 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  43.75 
 
 		 910 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.51 
 
 		 290 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  43.75 
 
 		 894 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1370  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.89 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1552  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.3 
 
 		 880 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679015 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3779  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  33.33 
 
 		 847 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2440  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000802988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1545  molybdopterin oxidoreductase  32.69 
 
 		 902 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  39.58 
 
 		 901 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3793  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  32.79 
 
 		 847 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0249011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.74 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3716  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  39.58 
 
 		 861 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1319  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  36.17 
 
 		 869 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  41.94 
 
 		 896 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  38.78 
 
 		 1228 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1024  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.29 
 
 		 841 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  39.58 
 
 		 891 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.5 
 
 		 278 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  32 
 
 		 942 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  34.69 
 
 		 882 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2722  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.68 
 
 		 834 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.11764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  35.85 
 
 		 285 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.33 
 
 		 850 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  39.58 
 
 		 1171 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.22 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05591  nitrate reductase  34.62 
 
 		 839 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  30.77 
 
 		 902 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3671  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  35.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3744  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.23042  normal  0.171499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.22 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  35.38 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  38.78 
 
 		 1176 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 281 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  40.82 
 
 		 897 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3561  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3842  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3671  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3835  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03216  nitrite reductase, large subunit, NAD(P)H-binding  31.15 
 
 		 847 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.76 
 
 		 837 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3647  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.78 
 
 		 294 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3741  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000001  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  34.62 
 
 		 419 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4676  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.54103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  31.15 
 
 		 847 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4046  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  31.48 
 
 		 850 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.78 
 
 		 294 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 90 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>