48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6395 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6395  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 		 85 aa  170  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.816862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2249  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0176531  decreased coverage  0.00631753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1914  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  50 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11607  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5033  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 89 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.354323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  41.38 
 
 		 901 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  41.51 
 
 		 1176 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  40.82 
 
 		 1228 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1766  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.82 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  39.22 
 
 		 1180 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  44.9 
 
 		 1188 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2440  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000802988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  46.43 
 
 		 910 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  36.54 
 
 		 905 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  41.67 
 
 		 885 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2803  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178552  normal  0.5 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  38 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  41.67 
 
 		 885 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2789  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.26 
 
 		 837 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2759  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  32.76 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  39.58 
 
 		 203 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  38 
 
 		 203 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1944  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 78 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1323  molybdopterin oxidoreductase  44 
 
 		 1094 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1548  molybdopterin oxidoreductase  45.1 
 
 		 1000 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118876  normal  0.471457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  42 
 
 		 897 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4124  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  35.09 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1385  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.18 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.277537  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  36 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3045  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.29628  normal  0.137112 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.67 
 
 		 904 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  38.78 
 
 		 885 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  42.55 
 
 		 804 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1076  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  38.89 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000245435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  40 
 
 		 885 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 		 894 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  36.84 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  36 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  43.75 
 
 		 892 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  27.78 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  27.78 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  27.78 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  27.78 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  27.78 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  27.78 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  43.48 
 
 		 942 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  27.78 
 
 		 79 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  27.78 
 
 		 79 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>