89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1076 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1076  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  100 
 
 		 84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000245435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1385  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  96.83 
 
 		 63 aa  127  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.277537  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  71.01 
 
 		 69 aa  100  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1079  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  50.98 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3139  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  44.23 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288105  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.23 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  44.23 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  42.31 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2236  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.584581  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1944  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  42.31 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.02 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0298  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  41.82 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.06 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  45.1 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0247  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  47.06 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42.86 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2384  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.43 
 
 		 830 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312411  normal  0.440122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  41.51 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  48.84 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  36.07 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4506  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.74 
 
 		 857 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3936  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.74 
 
 		 867 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00309412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4400  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.74 
 
 		 865 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.3242  normal  0.0318219 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13154  predicted protein  37.5 
 
 		 885 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5797  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.74 
 
 		 860 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.871719 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1754  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 		 851 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5033  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.354323 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0243  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.85 
 
 		 851 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.944133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1665  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 		 851 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1249  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 		 851 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130905  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1086  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 		 851 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521926  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0338  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 		 851 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0082  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 		 851 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.14 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.31 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  40.43 
 
 		 899 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0178  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.85 
 
 		 844 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  36.21 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  36.54 
 
 		 905 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4147  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.85 
 
 		 857 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385776  normal  0.0888504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10255  nitrite reductase NAD(P)H] large subunit  37.5 
 
 		 853 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.019775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.74 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1344  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.85 
 
 		 865 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.451527  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  46.81 
 
 		 901 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0245  nitrite reductase large subunit  33.93 
 
 		 858 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0794  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  39.62 
 
 		 882 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  36.07 
 
 		 1176 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3896  BFD-like [2Fe-2S]-binding region  38.46 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4276  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  32.08 
 
 		 851 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160671  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4164  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  32.08 
 
 		 851 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1222  nitrite reductase NADPH large subunit  32.08 
 
 		 852 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356268  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1744  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  35.19 
 
 		 853 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 891 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1380  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.58 
 
 		 849 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0248  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.5 
 
 		 880 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4818  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H-binding) large subunit precursor  32.08 
 
 		 853 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0268  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.5 
 
 		 880 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.229945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0258  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  37.5 
 
 		 880 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5924  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  41.67 
 
 		 814 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0194616  normal  0.0886236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6395  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.89 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.816862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1170  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  32.08 
 
 		 902 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0141525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  36 
 
 		 942 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  38.18 
 
 		 1180 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4860  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  30.19 
 
 		 853 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  35.48 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40 
 
 		 895 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  34.48 
 
 		 72 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  35.19 
 
 		 63 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>