96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3896 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3896  BFD-like [2Fe-2S]-binding region  100 
 
 		 72 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  91.67 
 
 		 72 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4522  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  76.39 
 
 		 72 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.185163  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1390  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  76.39 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4329  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  76.39 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1083  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  75 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.877882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1124  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  75 
 
 		 72 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.810619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1112  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  73.97 
 
 		 73 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  72.31 
 
 		 73 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  72.31 
 
 		 73 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2900  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  50.77 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  46.77 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.59 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  48.08 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  47.17 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.17 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  48.39 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46.43 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  55.1 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  43.4 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.35 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.35 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.35 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  40.35 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0429  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.040352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.35 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.57 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.4 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1370  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.86 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3040  bacterioferritin-associated ferredoxin  45.28 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3139  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  47.27 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288105  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.06 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  45.45 
 
 		 78 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  45.45 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2803  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178552  normal  0.5 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2759  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  32.39 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.27 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2789  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00053  bacterioferritin-associated ferredoxin  45.28 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2236  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.584581  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1079  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  41.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  41.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  41.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  41.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.74 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  41.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  41.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  41.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  41.82 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  44.9 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1944  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.32 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02744  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.38 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.532255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1024  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.63 
 
 		 841 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0437  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  44.93 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42.59 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0247  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  39.66 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3138  hypothetical protein  34.69 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191753  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1076  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  38.46 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000245435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.58 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0280  bacterioferritin-associated ferredoxin  35.09 
 
 		 64 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000223162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1328  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  41.3 
 
 		 870 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0740855  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  38.89 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1385  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.46 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.277537  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0245  nitrite reductase large subunit  31.48 
 
 		 858 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.03 
 
 		 203 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03660  nitrite reductase  43.14 
 
 		 849 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>