84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1397 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  100 
 
 		 64 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02744  bacterioferritin-associated ferredoxin  66.1 
 
 		 60 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.532255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  48.39 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  48.39 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  48.39 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  48.39 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  48.39 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.03 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  47.62 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  47.62 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  47.62 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  47.62 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  47.62 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.03 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.03 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.03 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  47.62 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  52.38 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  50.79 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  51.79 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.86 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  50.79 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3826  bacterioferritin-associated ferredoxin  50.98 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  52.83 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  51.79 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  51.79 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4005  bacterioferritin-associated ferredoxin  49.02 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000574852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0280  bacterioferritin-associated ferredoxin  46 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000223162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0320  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  36.51 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00053  bacterioferritin-associated ferredoxin  41.51 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2900  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  43.55 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3896  BFD-like [2Fe-2S]-binding region  46.43 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  51.85 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1390  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.21 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4522  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46.3 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.185163  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42.86 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0402  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  41.18 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000568559  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.64 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1370  bacterioferritin-associated ferredoxin  32.26 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0429  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.040352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4329  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1083  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42.86 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.877882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1124  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.810619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4547  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156495  normal  0.0108633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  50 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3040  bacterioferritin-associated ferredoxin  34.92 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1112  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.04 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46.81 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.46 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.46 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6041  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  31.75 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0247  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  37.04 
 
 		 894 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3045  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.29628  normal  0.137112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3138  hypothetical protein  41.18 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191753  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2789  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2803  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178552  normal  0.5 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2759  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  35.29 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40 
 
 		 69 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0705  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 58 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05582  hypothetical protein  36 
 
 		 887 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  38.89 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0298  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  44 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.43 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001602  assimilatory nitrate reductase large subunit  34 
 
 		 830 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0437  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.25 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>