118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3708 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
69 aa  140  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1838  bacterioferritin  55.56 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1769  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  55.56 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.06 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.93 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.71 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.66 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.1 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.94 
 
 
63 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  53.85 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2900  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  42.42 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.14 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  51.92 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.9 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  51.92 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.9 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.9 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4522  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.91 
 
 
72 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.185163  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42.86 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0247  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  51.02 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3040  bacterioferritin-associated ferredoxin  41.18 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.68 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.78 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.82 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  44.44 
 
 
203 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00053  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.74 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 
203 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.02 
 
 
278 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  42.59 
 
 
203 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.1 
 
 
72 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
64 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.94 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0298  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  44.44 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  48.78 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6041  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.31 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.74 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4329  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.31 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3896  BFD-like [2Fe-2S]-binding region  44.9 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  37.29 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  40.74 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  44.23 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2924  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  45.24 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0289108  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0280  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.29 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000223162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.74 
 
 
203 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1083  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.31 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.877882  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1124  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.31 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.810619  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  40 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1390  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.347567 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  40 
 
 
64 aa  43.9  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  40 
 
 
64 aa  43.9  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  40 
 
 
64 aa  43.9  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1112  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  40 
 
 
64 aa  43.9  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  35.29 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1076  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  36.21 
 
 
84 aa  43.5  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000245435  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  35.29 
 
 
79 aa  43.5  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.29 
 
 
79 aa  43.5  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  38 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1990  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  47.92 
 
 
801 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.29 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.64 
 
 
70 aa  42.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  31.43 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  31.43 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.43 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  38 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.29 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.29 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.29 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.29 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  38 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  38 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.43 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  34.62 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.74 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  38 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  38 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  38 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  38 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  38 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0320  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  35.09 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1086  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.55 
 
 
851 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0243  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  42.55 
 
 
851 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.944133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2196  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.18 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2236  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.43 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.584581  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0082  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.55 
 
 
851 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0338  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.55 
 
 
851 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1754  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.55 
 
 
851 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132112  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1665  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.55 
 
 
851 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1249  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  42.55 
 
 
851 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1079  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.43 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.43 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>