92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00053 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00053  bacterioferritin-associated ferredoxin  100 
 
 		 62 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  70.97 
 
 		 62 aa  94.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002301  bacterioferritin-associated ferredoxin  80.43 
 
 		 46 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0280  bacterioferritin-associated ferredoxin  51.92 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000223162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  41.51 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  41.67 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  41.67 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0402  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  51.92 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000568559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  41.67 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  41.67 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  41.67 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.23 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.23 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.23 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.23 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.23 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0320  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  48.08 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  48.08 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  52 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4522  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  52.83 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.185163  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  49.06 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  49.06 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3826  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.89 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  45.45 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4005  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.89 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000574852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4329  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.21 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1112  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.94 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1083  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  50.94 
 
 		 72 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.877882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1124  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.94 
 
 		 72 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.810619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  41.51 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02744  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.86 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.532255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1492  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40 
 
 		 846 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.566234  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.74 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1390  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5924  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  37.25 
 
 		 814 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0194616  normal  0.0886236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  45.16 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0838  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38 
 
 		 834 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000152863  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3896  BFD-like [2Fe-2S]-binding region  45.28 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3040  bacterioferritin-associated ferredoxin  40 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2722  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.22 
 
 		 834 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.11764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  38 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1370  bacterioferritin-associated ferredoxin  33.96 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3507  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.83 
 
 		 857 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.917816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1772  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.73 
 
 		 852 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00692778  normal  0.0180058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1815  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.62 
 
 		 875 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0949445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  33.87 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1441  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.5 
 
 		 1386 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6041  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  26.32 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2900  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  40.82 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2412  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.42 
 
 		 846 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000434604  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2799  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.17 
 
 		 882 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606225  decreased coverage  0.000990143 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.42 
 
 		 1373 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0794  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  34 
 
 		 882 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10255  nitrite reductase NAD(P)H] large subunit  37.5 
 
 		 853 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.019775 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42 
 
 		 895 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1332  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  35.29 
 
 		 837 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0149274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0429  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.040352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2176  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  34 
 
 		 833 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000870313  hitchhiker  0.00000985708 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  40.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  40.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  40.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  40.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  40.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  40.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  40.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  40.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1303  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.58 
 
 		 850 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.381253  normal  0.438898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  35.19 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2322  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor / assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit / assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  35.42 
 
 		 1328 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.33 
 
 		 837 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00961758  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>