69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3826 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3826  bacterioferritin-associated ferredoxin  100 
 
 		 64 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4005  bacterioferritin-associated ferredoxin  98.44 
 
 		 64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000574852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0320  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  70.31 
 
 		 64 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0280  bacterioferritin-associated ferredoxin  73.44 
 
 		 64 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000223162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0402  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  64.06 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000568559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  60.94 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  62.5 
 
 		 64 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  60.94 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  60.94 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  60.94 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  60.94 
 
 		 64 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  59.38 
 
 		 64 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  59.38 
 
 		 64 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  59.38 
 
 		 64 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  59.38 
 
 		 64 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  57.81 
 
 		 64 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  57.81 
 
 		 64 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  57.81 
 
 		 64 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  57.81 
 
 		 64 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  57.81 
 
 		 64 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4547  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  69.64 
 
 		 56 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156495  normal  0.0108633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  50.98 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.75 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.4 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.75 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  42.19 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00053  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.89 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3040  bacterioferritin-associated ferredoxin  35.94 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  37.68 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  36.84 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1370  bacterioferritin-associated ferredoxin  30.36 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02744  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.532255  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1323  molybdopterin oxidoreductase  35.85 
 
 		 1094 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.93 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  36.21 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  41.51 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  36.21 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05582  hypothetical protein  32.69 
 
 		 887 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  35.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1171  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  30.91 
 
 		 127 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2900  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  38.78 
 
 		 67 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  38.46 
 
 		 73 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  38.46 
 
 		 73 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.94 
 
 		 895 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0586  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  33.93 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  36.54 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001602  assimilatory nitrate reductase large subunit  32.65 
 
 		 830 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1390  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.46 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  27.78 
 
 		 971 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4522  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  32.31 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.185163  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6243  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  38.89 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  36.96 
 
 		 79 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>