More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1303 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01007  Nitrite reductase [NAD(P)H] (EC 1.7.1.4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22944]  43.99 
 
 		 1104 aa  692    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03216  nitrite reductase, large subunit, NAD(P)H-binding  56.85 
 
 		 847 aa  980    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.85 
 
 		 847 aa  980    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0338  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  60.07 
 
 		 851 aa  978    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1024  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.1 
 
 		 841 aa  1024    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  95.18 
 
 		 850 aa  1625    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0218384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3671  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.53 
 
 		 847 aa  979    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1705  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  97.18 
 
 		 850 aa  1644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0838  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  55.24 
 
 		 834 aa  826    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000152863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1970  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  73.08 
 
 		 966 aa  1226    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3835  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.85 
 
 		 847 aa  980    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1305  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  47.79 
 
 		 885 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462286 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03660  nitrite reductase  63.47 
 
 		 849 aa  1050    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1222  nitrite reductase NADPH large subunit  59.76 
 
 		 852 aa  988    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356268  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4947  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  60.14 
 
 		 866 aa  1030    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1811  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.4 
 
 		 889 aa  945    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.603082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3262  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  80.71 
 
 		 853 aa  1380    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3671  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.53 
 
 		 847 aa  979    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3744  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.53 
 
 		 847 aa  980    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.23042  normal  0.171499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3842  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.53 
 
 		 847 aa  980    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5659  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.89 
 
 		 854 aa  1031    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.150409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1086  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  60.07 
 
 		 851 aa  978    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2815  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  64.65 
 
 		 852 aa  1104    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.487055  normal  0.890112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3099  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  81.31 
 
 		 853 aa  1388    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.451682 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13154  predicted protein  45.76 
 
 		 885 aa  739    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4860  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  61.3 
 
 		 853 aa  1029    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3647  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.85 
 
 		 847 aa  980    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  54.41 
 
 		 837 aa  857    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3741  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.85 
 
 		 847 aa  980    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2799  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  50.29 
 
 		 882 aa  800    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606225  decreased coverage  0.000990143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4595  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.62 
 
 		 849 aa  968    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5797  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  59.17 
 
 		 860 aa  986    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.871719 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4400  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  59.13 
 
 		 865 aa  990    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.3242  normal  0.0318219 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0243  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.31 
 
 		 851 aa  981    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.944133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1492  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.69 
 
 		 846 aa  862    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.566234  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2494  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  64.86 
 
 		 1373 aa  1078    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4624  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  51.14 
 
 		 837 aa  841    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2879  nitrite reductase (NAD(P)H)subunit  51.18 
 
 		 971 aa  813    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1344  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  58.66 
 
 		 865 aa  978    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.451527  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3561  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.85 
 
 		 847 aa  978    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1665  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  60.07 
 
 		 851 aa  979    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2765  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.33 
 
 		 890 aa  945    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0345886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0172  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  69.24 
 
 		 837 aa  1160    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1552  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  58.06 
 
 		 880 aa  983    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.5 
 
 		 846 aa  982    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0245  nitrite reductase large subunit  60.5 
 
 		 858 aa  1045    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1170  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  61.27 
 
 		 902 aa  1005    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0141525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3779  nitrite reductase [NAD(P)H] large subunit  57.65 
 
 		 847 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0794  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  56.19 
 
 		 882 aa  890    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10255  nitrite reductase NAD(P)H] large subunit  52.22 
 
 		 853 aa  791    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.019775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1303  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  100 
 
 		 850 aa  1740    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.381253  normal  0.438898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6175  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  54.01 
 
 		 856 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0082  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  60.07 
 
 		 851 aa  978    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4164  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  58.94 
 
 		 851 aa  996    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2906  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  63.2 
 
 		 1381 aa  1060    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2322  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor / assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit / assimilatory nitrate reductase (NADH) beta subunit  63.88 
 
 		 1328 aa  1034    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2355  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  61.87 
 
 		 851 aa  1038    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000467029  normal  0.479007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0319  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  61.39 
 
 		 854 aa  1029    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0798  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit  55.88 
 
 		 858 aa  920    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2214  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  60.5 
 
 		 862 aa  1030    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0126186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3716  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  61.46 
 
 		 861 aa  1042    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2384  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  52.47 
 
 		 830 aa  870    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312411  normal  0.440122 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1754  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  60.31 
 
 		 851 aa  981    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1117  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  71.55 
 
 		 841 aa  1206    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2058  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  54.2 
 
 		 823 aa  870    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0297  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  52.39 
 
 		 851 aa  765    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.27 
 
 		 837 aa  884    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00961758  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1319  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  58.97 
 
 		 869 aa  1011    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4818  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H-binding) large subunit precursor  60.77 
 
 		 853 aa  1007    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4676  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  56.85 
 
 		 847 aa  980    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.54103 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2391  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  57.02 
 
 		 856 aa  882    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4276  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  58.94 
 
 		 851 aa  996    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160671  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0258  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  53.39 
 
 		 880 aa  776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0309193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1441  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  64.47 
 
 		 1386 aa  1076    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2534  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  63.66 
 
 		 861 aa  1069    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05591  nitrate reductase  60 
 
 		 839 aa  1020    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0387  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  53.27 
 
 		 852 aa  790    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1332  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  53.91 
 
 		 837 aa  920    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0149274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2730  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  63.37 
 
 		 1396 aa  1066    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18820  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  48.58 
 
 		 891 aa  683    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0317418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0248  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  53.5 
 
 		 880 aa  776    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2176  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.11 
 
 		 833 aa  887    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000870313  hitchhiker  0.00000985708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1509  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.11 
 
 		 867 aa  917    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1249  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  60.07 
 
 		 851 aa  978    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130905  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3936  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60 
 
 		 867 aa  991    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00309412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0235  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.42 
 
 		 848 aa  1006    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1258  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  47.9 
 
 		 879 aa  717    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.993726  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4147  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.6 
 
 		 857 aa  999    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385776  normal  0.0888504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0347  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.85 
 
 		 847 aa  980    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4506  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  59.64 
 
 		 857 aa  988    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3793  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.69 
 
 		 847 aa  976    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0249011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1875  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  57.76 
 
 		 880 aa  956    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.654316  hitchhiker  0.000051224 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1744  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  54.39 
 
 		 853 aa  863    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  56.39 
 
 		 850 aa  994    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3956  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  57.42 
 
 		 848 aa  1006    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2004  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.99 
 
 		 838 aa  1009    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1983  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  60.73 
 
 		 846 aa  1040    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.385914  normal  0.488023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0178  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  61.85 
 
 		 844 aa  1044    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4015  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  97.29 
 
 		 850 aa  1648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0352  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  54.31 
 
 		 838 aa  824    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.628681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>