50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0402 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0402  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
64 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000568559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0320  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  84.38 
 
 
64 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4005  bacterioferritin-associated ferredoxin  65.62 
 
 
64 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000574852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3826  bacterioferritin-associated ferredoxin  64.06 
 
 
64 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0280  bacterioferritin-associated ferredoxin  67.19 
 
 
64 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000223162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  54.69 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  54.69 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  54.69 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  54.69 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  56.25 
 
 
64 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  60.38 
 
 
64 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  60.38 
 
 
64 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  60.38 
 
 
64 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  60.38 
 
 
64 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  60.38 
 
 
64 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4547  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50 
 
 
56 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156495  normal  0.0108633 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.67 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00053  bacterioferritin-associated ferredoxin  51.92 
 
 
62 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  41.18 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1370  bacterioferritin-associated ferredoxin  32.26 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.31 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.4 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.35 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  38.1 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  35.71 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  35.94 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.62 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.18 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.68 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  42.31 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.17 
 
 
72 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  34.38 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  35.09 
 
 
69 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  35.94 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6243  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  36.07 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  41.3 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.74 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  34.43 
 
 
68 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.85 
 
 
63 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>