83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2900 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2900  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  100 
 
 
67 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  51.52 
 
 
72 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3896  BFD-like [2Fe-2S]-binding region  50.77 
 
 
72 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4329  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
72 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1124  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
72 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.810619  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1083  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.76 
 
 
72 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.877882  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  57.41 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  57.41 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4522  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  47.69 
 
 
72 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.185163  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1390  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.77 
 
 
72 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.347567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1112  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
73 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.28 
 
 
68 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  47.17 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.81 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  43.55 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42.42 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  41.07 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1370  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.88 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.38 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  41.07 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.07 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.07 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.07 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.07 
 
 
63 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  39.29 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46.15 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.89 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.07 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  39.34 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  41.07 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  33.93 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  33.93 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  33.93 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  33.93 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  33.93 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.07 
 
 
63 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  36.36 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.29 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02744  bacterioferritin-associated ferredoxin  41.82 
 
 
60 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.532255  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  45.65 
 
 
203 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0429  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.25 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.040352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.65 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.04 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  48.72 
 
 
203 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3040  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.34 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.82 
 
 
200 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.15 
 
 
203 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  41.3 
 
 
203 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00053  bacterioferritin-associated ferredoxin  40.82 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.48 
 
 
203 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3045  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.29628  normal  0.137112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.3 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.44 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  36.21 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2803  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.58 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178552  normal  0.5 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2759  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  39.58 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2196  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  43.14 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2789  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.58 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345814  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0705  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.9 
 
 
58 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3826  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.78 
 
 
64 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.58 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6041  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.5 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0320  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  32.69 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0751  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
61 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4005  bacterioferritin-associated ferredoxin  36.73 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000574852  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  35 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3139  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  40.48 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288105  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1319  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  47.73 
 
 
869 aa  40.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>