54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6041 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6041  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 		 97 aa  186  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0705  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  53.45 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.84 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  43.9 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4124  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.88 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  50 
 
 		 837 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  41.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2803  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178552  normal  0.5 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2759  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  37.5 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2789  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  39.53 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3040  bacterioferritin-associated ferredoxin  36.67 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.31 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  43.9 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  43.9 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  47.27 
 
 		 837 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00961758  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1766  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  31.75 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5033  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.354323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  46.34 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00053  bacterioferritin-associated ferredoxin  26.32 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4522  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46.34 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.185163  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  40 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.02 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  37.21 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0978  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.93 
 
 		 484 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  36.07 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2722  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44.44 
 
 		 834 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.11764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4947  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  44.74 
 
 		 866 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  41.46 
 
 		 68 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1249  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.83 
 
 		 851 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130905  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1665  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.83 
 
 		 851 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1754  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.83 
 
 		 851 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0338  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.83 
 
 		 851 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0082  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.83 
 
 		 851 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.02 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0243  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  45.83 
 
 		 851 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.944133  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1086  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  45.83 
 
 		 851 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2900  BFD-like (2Fe-2S)-binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.981323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  41.46 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  39.02 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>