44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5033 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5033  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.354323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  52 
 
 
894 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6395  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.06 
 
 
85 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.816862  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  50 
 
 
910 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  47.06 
 
 
897 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1914  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46.03 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11607  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3774  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36.51 
 
 
813 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.541337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2800  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.83 
 
 
541 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000731834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1766  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  46.94 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  45.71 
 
 
895 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  47.37 
 
 
895 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2249  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0176531  decreased coverage  0.00631753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1548  molybdopterin oxidoreductase  41.1 
 
 
1000 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118876  normal  0.471457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
475 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00187613  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  43.75 
 
 
804 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4259  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.84 
 
 
478 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0277148  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1076  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  35.71 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000245435  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2440  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.82 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000802988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.89 
 
 
478 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6041  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.14 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  47.27 
 
 
892 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4124  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  42.55 
 
 
891 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
899 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40 
 
 
942 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40 
 
 
873 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  31.25 
 
 
905 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  39.58 
 
 
883 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  46.43 
 
 
901 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1385  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  35.19 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.277537  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  45.45 
 
 
896 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1323  molybdopterin oxidoreductase  39.62 
 
 
1094 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 
479 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2789  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.67 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345814  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2803  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.67 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178552  normal  0.5 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2759  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  36.67 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
479 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  44.19 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40 
 
 
895 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1266  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  36.84 
 
 
825 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0963412  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0397  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.87 
 
 
834 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17666  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2412  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.88 
 
 
846 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000434604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2245  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  34.62 
 
 
837 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.240706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0705  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40 
 
 
58 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>