75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1385 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1385  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.277537  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1076  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  96.83 
 
 
84 aa  127  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000245435  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  69.57 
 
 
69 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1079  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.08 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.23 
 
 
78 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.23 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.23 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  44.23 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  50.98 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.23 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2236  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.23 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.584581  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  42.31 
 
 
79 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.31 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  42.31 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1944  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.06 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535919  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.02 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3139  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  44.9 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288105  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.06 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0298  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  42.11 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  45.1 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  42.86 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0247  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  42.37 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  41.51 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  48.84 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  51.22 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4400  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.74 
 
 
865 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.3242  normal  0.0318219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3936  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.74 
 
 
867 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00309412  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1744  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  37.04 
 
 
853 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  40.43 
 
 
899 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1086  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 
851 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1249  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 
851 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130905  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1665  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 
851 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1754  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 
851 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.74 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0338  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 
851 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  46.81 
 
 
901 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0082  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  35.85 
 
 
851 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0243  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.85 
 
 
851 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.944133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0178  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.85 
 
 
844 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.31 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  36.54 
 
 
905 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  39.62 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0794  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  40.68 
 
 
882 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0245  nitrite reductase large subunit  35.71 
 
 
858 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4147  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  35.85 
 
 
857 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385776  normal  0.0888504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10255  nitrite reductase NAD(P)H] large subunit  37.5 
 
 
853 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.019775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3896  BFD-like [2Fe-2S]-binding region  38.46 
 
 
72 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5033  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.19 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.354323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  38.18 
 
 
1176 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6395  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.18 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.816862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2384  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  40.43 
 
 
830 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312411  normal  0.440122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  36.36 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1222  nitrite reductase NADPH large subunit  32.08 
 
 
852 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356268  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.54 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5797  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.74 
 
 
860 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.871719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.54 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.74 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.93 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  36 
 
 
942 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4506  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.74 
 
 
857 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156968  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1380  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.58 
 
 
849 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0248  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.5 
 
 
880 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120647  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0268  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.5 
 
 
880 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.229945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.18 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0258  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  37.5 
 
 
880 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0309193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5924  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  41.67 
 
 
814 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0194616  normal  0.0886236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  37.74 
 
 
891 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40 
 
 
895 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2730  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.93 
 
 
1396 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>