72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2115 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 		 69 aa  140  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1076  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  71.01 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000245435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1385  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  69.57 
 
 		 63 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.277537  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1079  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  59.62 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  55.77 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  55.77 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  55.77 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  55.77 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  55.77 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2236  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  55.77 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.584581  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  50 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  50 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  50 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  50 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  50 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  50 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  50 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  50 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3139  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  53.06 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288105  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1944  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  54.9 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  48.98 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  52.94 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  50.98 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0298  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46.94 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  47.06 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2384  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.58 
 
 		 830 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312411  normal  0.440122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0247  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  48.98 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5797  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.33 
 
 		 860 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.871719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4147  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.33 
 
 		 857 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.385776  normal  0.0888504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3936  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.75 
 
 		 867 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00309412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4506  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  33.33 
 
 		 857 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4400  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  43.75 
 
 		 865 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.3242  normal  0.0318219 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1249  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.88 
 
 		 851 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130905  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1665  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.88 
 
 		 851 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1754  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.88 
 
 		 851 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132112  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1086  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.88 
 
 		 851 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0243  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  31.88 
 
 		 851 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.944133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0338  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.88 
 
 		 851 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  41.67 
 
 		 899 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0082  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  31.88 
 
 		 851 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0178  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  30.43 
 
 		 844 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0245  nitrite reductase large subunit  41.18 
 
 		 858 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0586  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  37.25 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1344  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  41.67 
 
 		 865 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.451527  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4860  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  30.43 
 
 		 853 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  33.33 
 
 		 905 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10255  nitrite reductase NAD(P)H] large subunit  39.58 
 
 		 853 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.019775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  37.5 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  36.76 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.33 
 
 		 895 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.68 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  43.75 
 
 		 891 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  43.14 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.51 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  34.33 
 
 		 1176 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1170  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.43 
 
 		 902 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0141525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1744  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  36.54 
 
 		 853 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  40.74 
 
 		 69 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  34.85 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4818  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H-binding) large subunit precursor  27.54 
 
 		 853 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2214  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit precursor  37.5 
 
 		 862 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0126186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2730  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.5 
 
 		 1396 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2412  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  36 
 
 		 846 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000434604  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  36.17 
 
 		 804 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.5 
 
 		 837 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4260  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  39.58 
 
 		 837 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00961758  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  36.36 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>