72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0298 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0298  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  100 
 
 
130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0247  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  76.24 
 
 
101 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  57.89 
 
 
91 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  60 
 
 
91 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  56.84 
 
 
91 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  49.09 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  47.27 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  46.43 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  46.43 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1079  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.43 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.02 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.43 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.43 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46.43 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2236  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.43 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.584581  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.43 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.02 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1944  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.64 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535919  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3139  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.86 
 
 
82 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288105  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
64 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.3 
 
 
78 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  49.02 
 
 
67 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1076  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  41.82 
 
 
84 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000245435  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3310  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4621  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.08 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384762  hitchhiker  0.000170224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  45.16 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.94 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1385  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  42.11 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.277537  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2567  hypothetical protein  47.06 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0836359  hitchhiker  0.000786438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  39.29 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.94 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2405  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.28 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1443  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  45.28 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  32.84 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  44.44 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3050  hypothetical protein  36.25 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1390  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.1 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.347567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  37.74 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3077  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.97 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00396476  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.31 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.82 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  43.14 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  43.14 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  34.78 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  28.36 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3040  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.34 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0429  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.040352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.74 
 
 
63 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1259  hypothetical protein  44.9 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  37.04 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.18 
 
 
203 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  44 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.78 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.36 
 
 
203 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  38.78 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0586  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>