36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1259 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1259  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  148  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1443  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  55.56 
 
 
90 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2405  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  55.56 
 
 
90 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3310  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  68.09 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4621  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  63.83 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384762  hitchhiker  0.000170224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2567  hypothetical protein  65.96 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0836359  hitchhiker  0.000786438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3050  hypothetical protein  63.83 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3077  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  58 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00396476  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3139  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  51.02 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288105  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  51.02 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1079  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  50.98 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  42.25 
 
 
79 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  49.02 
 
 
78 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  42.25 
 
 
79 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  45.1 
 
 
79 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  49.02 
 
 
78 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.02 
 
 
78 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.02 
 
 
78 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  45.1 
 
 
79 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  45.1 
 
 
79 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  45.1 
 
 
79 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  45.1 
 
 
79 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  45.1 
 
 
79 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2236  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.02 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.584581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0586  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  49.02 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  46.15 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  46.15 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  44.23 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  33.33 
 
 
64 aa  42.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1944  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  44.23 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535919  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  44.44 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0298  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  44.9 
 
 
130 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.14 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.68 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  33.96 
 
 
1228 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>