83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0247 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0247  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  100 
 
 		 101 aa  202  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0298  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  76.24 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0205  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  58.95 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664847  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0224  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  56.84 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0349  putative bacterioferritin-associated ferredoxin protein  56.84 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0630258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0456  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  54.9 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0705  bacterioferritin-associated ferredoxin  51.72 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.901499  normal  0.177306 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  41.25 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3516  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  47.37 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2833  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.547055  normal  0.0381011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0638  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  48.08 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0523  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277187  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1800  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1933  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  43.14 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0797  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2061  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2023  bacterioferritin-associated ferredoxin, putative  43.14 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0620  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40279  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1089  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1169  bacterioferritin-associated ferredoxin  51.02 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.103324  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1058  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  49.02 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2197  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.781849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2222  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0309994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5880  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  43.1 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3310  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  51.02 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5526  bacterioferritin-associated ferredoxin  43.14 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3077  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00396476  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1076  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  47.06 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000245435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3708  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  51.02 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1079  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2236  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.584581  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1385  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  42.37 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.277537  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3139  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  41.38 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288105  normal  0.0198862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1944  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2115  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1390  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.347567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  45.28 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2405  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4621  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384762  hitchhiker  0.000170224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18680  hypothetical protein  46.94 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.349817 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1443  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  48.98 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1410  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.78 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.0951764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2567  hypothetical protein  43.14 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0836359  hitchhiker  0.000786438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1617  hypothetical protein  46.94 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3324  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.168407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4187  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3040  bacterioferritin-associated ferredoxin  42.86 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  46 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1692  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.82 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000131795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0782  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2803  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178552  normal  0.5 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0542  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2789  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0581  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.746355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0552  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3295  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2759  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  40.82 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.68 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3783  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3726  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  38.78 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3909  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.81 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3448  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3217  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  37.04 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000400895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3896  BFD-like [2Fe-2S]-binding region  39.66 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0429  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 66 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.040352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0582  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 63 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.661749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3050  hypothetical protein  44.9 
 
 		 102 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0583  bacterioferritin-associated ferredoxin  36.73 
 
 		 63 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4159  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.9 
 
 		 72 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  28.12 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  28.12 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  28.12 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  28.12 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4522  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  33.87 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.185163  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  42.55 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2431  hypothetical protein  35.29 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0315266  normal  0.554875 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  28.12 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3555  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  42.55 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.43 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  40.43 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>