54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1914 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1914  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  100 
 
 		 70 aa  133  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11607  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2249  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  75 
 
 		 64 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0176531  decreased coverage  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6395  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.816862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1323  molybdopterin oxidoreductase  44.44 
 
 		 1094 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  40.38 
 
 		 905 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5033  BFD domain-containing protein (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.354323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  44.23 
 
 		 880 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  48.15 
 
 		 895 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  46.15 
 
 		 892 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  39.58 
 
 		 899 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1548  molybdopterin oxidoreductase  39.34 
 
 		 1000 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118876  normal  0.471457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  31.67 
 
 		 915 aa  48.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  46.3 
 
 		 895 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.93 
 
 		 846 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  47.17 
 
 		 879 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  40.74 
 
 		 891 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1766  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  45.1 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  45.31 
 
 		 896 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  34.25 
 
 		 967 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2722  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  44 
 
 		 834 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.11764 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2440  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000802988  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  38.78 
 
 		 907 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  47.92 
 
 		 894 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  44 
 
 		 895 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  43.14 
 
 		 1180 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2321  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.31 
 
 		 835 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  42.31 
 
 		 901 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  47.92 
 
 		 910 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3793  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.93 
 
 		 847 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0249011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.43 
 
 		 904 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  41.67 
 
 		 1176 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0091  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  37.93 
 
 		 633 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  43.75 
 
 		 897 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.92 
 
 		 296 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  38.78 
 
 		 882 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001602  assimilatory nitrate reductase large subunit  31.58 
 
 		 830 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.18 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.18 
 
 		 284 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.22 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3869  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.93 
 
 		 850 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2168  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.86 
 
 		 483 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586503  hitchhiker  0.00172973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 883 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  34.69 
 
 		 894 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1024  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  34.48 
 
 		 841 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.22 
 
 		 290 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.1 
 
 		 288 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0838  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  46 
 
 		 834 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000152863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4046  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  37.93 
 
 		 850 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0883  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3716  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  34.43 
 
 		 861 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.59 
 
 		 298 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.22 
 
 		 284 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2058  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  38.33 
 
 		 823 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  37.93 
 
 		 1173 aa  40.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>