24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4547 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4547  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  100 
 
 
56 aa  116  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000156495  normal  0.0108633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0280  bacterioferritin-associated ferredoxin  69.64 
 
 
64 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000223162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3826  bacterioferritin-associated ferredoxin  69.64 
 
 
64 aa  84  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4005  bacterioferritin-associated ferredoxin  67.86 
 
 
64 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000574852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0320  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  57.14 
 
 
64 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0402  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000568559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3755  bacterioferritin-associated ferredoxin  50 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000454132  decreased coverage  0.000875813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3713  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0236096  normal  0.567834 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03139  hypothetical protein  44.64 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3811  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000341007  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3640  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00231672  normal  0.296086 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3748  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  0.0980641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03188  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.64 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0376  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.64 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160101  normal  0.665308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3531  bacterioferritin-associated ferredoxin  44.64 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.495948  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0376  BFD domain protein (2Fe-2S)-binding domain protein  44.64 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3712  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000134622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3619  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000258442  hitchhiker  0.00460486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4647  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345625  normal  0.0405704 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3807  bacterioferritin-associated ferredoxin  46.43 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1397  BFD-like (2Fe-2S)-binding region  50 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02744  bacterioferritin-associated ferredoxin  45.24 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.532255  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2775  bacterioferritin-associated ferredoxin  39.13 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>