213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3319 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3319  acetyl/acyl transferase related protein  100 
 
 
224 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1700  hexapaptide repeat-containing transferase  34.63 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  23.04 
 
 
252 aa  62.4  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  28.97 
 
 
199 aa  62.4  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  29.65 
 
 
243 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  26 
 
 
254 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  26.9 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  26.05 
 
 
251 aa  59.3  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  26.79 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.87 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5491  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.44 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  27.33 
 
 
159 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  21.78 
 
 
251 aa  55.1  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  30.49 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  27.7 
 
 
175 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  34.97 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.56 
 
 
167 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  27.33 
 
 
175 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
843 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  37.07 
 
 
191 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  29.41 
 
 
166 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  29.46 
 
 
310 aa  52.4  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  29.86 
 
 
197 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 
842 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.09 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4502  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  25.93 
 
 
322 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  28.75 
 
 
312 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  23.21 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4938  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  28.89 
 
 
335 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0964903  normal  0.0759463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3380  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.49 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00368605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.77 
 
 
842 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0518  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.49 
 
 
561 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
517 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2186  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  29.5 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3051  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.49 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0324  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.49 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0337  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.49 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.116008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2243  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.49 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.164463  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  32.43 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2933  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.09 
 
 
452 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.277455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2041  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.49 
 
 
561 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.03 
 
 
193 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.5 
 
 
168 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  29.46 
 
 
313 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  29.87 
 
 
517 aa  48.5  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0312  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.19 
 
 
462 aa  48.5  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15443  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0289  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.49 
 
 
468 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.874602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0446  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  30.97 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0030  hypothetical protein  27.81 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0213318  hitchhiker  0.00700368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4589  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.18 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  26.49 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  33.62 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  31.34 
 
 
182 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  30.6 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3624  hexapaptide repeat-containing transferase  34.68 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  28.95 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0122  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.67 
 
 
457 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00146823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
316 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0439  putative sugar acetyltransferase  28.98 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.627014  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1064  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.71 
 
 
300 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.084361  normal  0.192222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0709  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.47 
 
 
460 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.21 
 
 
168 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14160  putative acetyltransferase  29.03 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  27.27 
 
 
160 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1527  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.64 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.584038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2683  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  30.65 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000102069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  31.11 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1877  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  30.37 
 
 
231 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1258  transferase  30.6 
 
 
229 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00666  serine acetyltransferase  31.15 
 
 
159 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0072  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  33.74 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  28.47 
 
 
309 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3001  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.65 
 
 
453 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2367  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.65 
 
 
453 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2981  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.65 
 
 
453 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  28.47 
 
 
159 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.78 
 
 
236 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2079  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.12 
 
 
462 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1531  hexapaptide repeat-containing transferase  31.71 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000154529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3394  Serine acetyltransferase-like protein  30.91 
 
 
180 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.46 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2602  acetyltransferase-like protein  30.08 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5775  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.26 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  25.13 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5874  serine O-acetyltransferase  38.03 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1217  Serine acetyltransferase  47.83 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1784  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.32 
 
 
452 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.907512  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  30.22 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0251  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3819  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  27.14 
 
 
258 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0731893  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  29.84 
 
 
169 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0668  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  28.67 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3057  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.6 
 
 
452 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  27.46 
 
 
160 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  27.78 
 
 
545 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  27.13 
 
 
317 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  24.32 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  29.35 
 
 
571 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  24.82 
 
 
171 aa  45.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0906  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  31.88 
 
 
285 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.532634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>