234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0117 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0117  IS630 family transposase  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4112  IS630 family transposase  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0070  IS630 family transposase  51.01 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3006  IS630 family transposase  51.01 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3071  IS630 family transposase  51.01 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6340  IS630 family transposase  51.01 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7158  IS630 family transposase  51.01 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.0630141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  50.51 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  50.51 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8269  hypothetical protein  52.41 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3885  IS630 family transposase  46.08 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00204873  normal  0.0220373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1869  hypothetical protein  48.12 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557561  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6559  hypothetical protein  51.24 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.95 
 
 		 336 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.95 
 
 		 336 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.95 
 
 		 336 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.95 
 
 		 336 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.95 
 
 		 336 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.95 
 
 		 336 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.95 
 
 		 336 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3635  putative transposase  35.68 
 
 		 186 aa  84.7  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  28.57 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  28.57 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  28.57 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2883  hypothetical protein  48.31 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000785138  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3098  hypothetical protein  100 
 
 		 53 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  30.81 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0191  IS630 family transposase  51.67 
 
 		 79 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  30.16 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  28.26 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  30.73 
 
 		 352 aa  61.6  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  24.35 
 
 		 350 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  30.17 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  30.17 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  30.17 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  29.89 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  26.67 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1451  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.6 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  30.17 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  29.61 
 
 		 352 aa  58.5  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  23.83 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  29.61 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4118  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.55 
 
 		 338 aa  58.2  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  25.27 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  25.27 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  25.27 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  25.27 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  29.61 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  25.27 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2595  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.71 
 
 		 333 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  24.51 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4509  hypothetical protein  24.86 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  27.08 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  29.61 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  33.57 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  33.57 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  24.6 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  26.56 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  26.56 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  26.56 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  26.56 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  26.56 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  32.87 
 
 		 351 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  32.39 
 
 		 322 aa  52.4  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  33.33 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  25.5 
 
 		 345 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  25.29 
 
 		 362 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2447  hypothetical protein  37.1 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.146919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21.71 
 
 		 350 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21.71 
 
 		 350 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  29.78 
 
 		 314 aa  48.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21.71 
 
 		 350 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21.71 
 
 		 350 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  33.33 
 
 		 322 aa  48.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>