64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2883 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2883  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  293  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000785138  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1869  hypothetical protein  79.55 
 
 		 165 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557561  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3071  IS630 family transposase  63.64 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  63.64 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  63.64 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0070  IS630 family transposase  63.64 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7158  IS630 family transposase  63.64 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.0630141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3006  IS630 family transposase  63.64 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6340  IS630 family transposase  63.64 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0117  IS630 family transposase  48.31 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4112  IS630 family transposase  48.31 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8269  hypothetical protein  40.91 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0191  IS630 family transposase  52.73 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  43.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  43.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  43.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  43.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  43.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  43.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  43.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  41.3 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  43.18 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  43.18 
 
 		 345 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  32.79 
 
 		 207 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  33.33 
 
 		 344 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3885  IS630 family transposase  33.73 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00204873  normal  0.0220373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  35.09 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2447  hypothetical protein  38.18 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.146919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.86 
 
 		 336 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.86 
 
 		 336 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.86 
 
 		 336 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.86 
 
 		 336 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.86 
 
 		 336 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.86 
 
 		 336 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.86 
 
 		 336 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  34.78 
 
 		 345 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  34 
 
 		 348 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  34 
 
 		 348 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  34 
 
 		 348 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  34 
 
 		 348 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6559  hypothetical protein  33.04 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  34 
 
 		 348 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  34 
 
 		 348 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  30.61 
 
 		 345 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  30.61 
 
 		 345 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  30.61 
 
 		 345 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  37.93 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  32.61 
 
 		 314 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  33.33 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  32.79 
 
 		 337 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1024  Transposase-like protein  32.79 
 
 		 197 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2335  Transposase-like protein  32.79 
 
 		 197 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0120491  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2415  Transposase-like protein  32.79 
 
 		 197 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0139187  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2499  Transposase-like protein  32.79 
 
 		 197 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2561  Transposase-like protein  32.79 
 
 		 189 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  32.79 
 
 		 337 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2854  Transposase-like protein  32.79 
 
 		 197 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  37.78 
 
 		 342 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  28.57 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  28.57 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.57 
 
 		 350 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.98 
 
 		 350 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>