16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6559 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6559  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0117  IS630 family transposase  51.24 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4112  IS630 family transposase  51.24 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8269  hypothetical protein  35.34 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0070  IS630 family transposase  36.36 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3006  IS630 family transposase  36.36 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3071  IS630 family transposase  36.36 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  36.36 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  36.36 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6340  IS630 family transposase  36.36 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7158  IS630 family transposase  36.36 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.0630141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3885  IS630 family transposase  38.16 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00204873  normal  0.0220373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3098  hypothetical protein  69.7 
 
 		 53 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1869  hypothetical protein  35.09 
 
 		 165 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557561  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2883  hypothetical protein  33.9 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000785138  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0191  IS630 family transposase  77.27 
 
 		 79 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.413913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>