56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3885 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3885  IS630 family transposase  100 
 
 
191 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00204873  normal  0.0220373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0117  IS630 family transposase  46.08 
 
 
207 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4112  IS630 family transposase  46.08 
 
 
207 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7158  IS630 family transposase  46.5 
 
 
206 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.0630141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6340  IS630 family transposase  46.5 
 
 
206 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  46.5 
 
 
206 aa  167  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0070  IS630 family transposase  46.5 
 
 
206 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3006  IS630 family transposase  46.5 
 
 
206 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3071  IS630 family transposase  46.5 
 
 
206 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  46.5 
 
 
206 aa  167  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8269  hypothetical protein  44.15 
 
 
206 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1869  hypothetical protein  38.56 
 
 
165 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557561  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0191  IS630 family transposase  43.59 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3635  putative transposase  28.95 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  26.4 
 
 
342 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  26.4 
 
 
342 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  26.4 
 
 
342 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.37 
 
 
336 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.37 
 
 
336 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.37 
 
 
336 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.37 
 
 
336 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.37 
 
 
336 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.37 
 
 
336 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.37 
 
 
336 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6559  hypothetical protein  38.16 
 
 
235 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  27.96 
 
 
202 aa  51.6  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  27.96 
 
 
352 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0416  hypothetical protein  48.98 
 
 
102 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  27.23 
 
 
352 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  27.42 
 
 
352 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  27.42 
 
 
347 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6778  hypothetical protein  47.06 
 
 
111 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  26.52 
 
 
350 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  27.42 
 
 
350 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  26.34 
 
 
352 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  27.42 
 
 
293 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2883  hypothetical protein  33.73 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000785138  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  26.88 
 
 
352 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1019  transposase-like protein  27.54 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.42618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1808  transposase-like protein  27.54 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00181251  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  26.88 
 
 
348 aa  45.1  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  27.55 
 
 
351 aa  44.7  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  28.86 
 
 
332 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  28.86 
 
 
332 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  27.62 
 
 
345 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  28.67 
 
 
322 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  26.37 
 
 
188 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>