178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1869 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1869  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  330  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557561  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0070  IS630 family transposase  70.91 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3006  IS630 family transposase  70.91 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3071  IS630 family transposase  70.91 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6340  IS630 family transposase  70.91 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7158  IS630 family transposase  70.91 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.0630141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  70.3 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  70.3 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2883  hypothetical protein  79.55 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000785138  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0117  IS630 family transposase  48.12 
 
 		 207 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4112  IS630 family transposase  48.12 
 
 		 207 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8269  hypothetical protein  46.3 
 
 		 206 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3885  IS630 family transposase  39.22 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00204873  normal  0.0220373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0416  hypothetical protein  80.7 
 
 		 102 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6778  hypothetical protein  68.97 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.36 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.36 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.36 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.36 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.36 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.36 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.36 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0191  IS630 family transposase  45 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  28.57 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  27.21 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  27.21 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  27.21 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6559  hypothetical protein  34.21 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  37.1 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.78 
 
 		 350 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2447  hypothetical protein  40.32 
 
 		 194 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.146919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3635  putative transposase  31.31 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  51.2  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  50.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.38 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 		 350 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  27.66 
 
 		 342 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  27.66 
 
 		 342 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  27.66 
 
 		 342 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  27.27 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 349 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.08 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  27.08 
 
 		 342 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  30.68 
 
 		 350 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  33.82 
 
 		 319 aa  47.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  29.9 
 
 		 347 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  30.43 
 
 		 352 aa  47.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  22.43 
 
 		 350 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  22.43 
 
 		 350 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  33.78 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  27.52 
 
 		 308 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21.68 
 
 		 350 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  29.35 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  21.74 
 
 		 345 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3769  IS630 family transposase  33.33 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  31.76 
 
 		 352 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  30.43 
 
 		 348 aa  44.3  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1024  Transposase-like protein  33.82 
 
 		 197 aa  43.9  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2335  Transposase-like protein  33.82 
 
 		 197 aa  43.9  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0120491  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2415  Transposase-like protein  33.82 
 
 		 197 aa  43.9  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0139187  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2499  Transposase-like protein  33.82 
 
 		 197 aa  43.9  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2561  Transposase-like protein  33.82 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2854  Transposase-like protein  33.82 
 
 		 197 aa  43.9  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4509  hypothetical protein  31.65 
 
 		 163 aa  44.3  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  33.82 
 
 		 337 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  33.82 
 
 		 337 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1410  transposase  26.53 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176947  normal  0.221999 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  35.82 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  35.82 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  35.82 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  35.82 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  24.44 
 
 		 344 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  35.8 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  35.8 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00314  transposase  32.86 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.869497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  35.82 
 
 		 282 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02694  transposase  32.86 
 
 		 91 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>