108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0191 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0191  IS630 family transposase  100 
 
 		 79 aa  161  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8269  hypothetical protein  64.29 
 
 		 206 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0070  IS630 family transposase  53.09 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3006  IS630 family transposase  53.09 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3071  IS630 family transposase  53.09 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  53.09 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  53.09 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6340  IS630 family transposase  53.09 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7158  IS630 family transposase  53.09 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.0630141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0117  IS630 family transposase  51.67 
 
 		 207 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4112  IS630 family transposase  51.67 
 
 		 207 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1869  hypothetical protein  45 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557561  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3885  IS630 family transposase  43.59 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00204873  normal  0.0220373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2883  hypothetical protein  52.73 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000785138  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4995  hypothetical protein  47.06 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3589  hypothetical protein  47.06 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.303054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  35.82 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1410  transposase  41.38 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176947  normal  0.221999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  48.65 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  48.65 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  48.65 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  48.65 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  48.65 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  37.5 
 
 		 348 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  37.5 
 
 		 348 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  37.5 
 
 		 348 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  48.65 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  37.5 
 
 		 348 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  37.5 
 
 		 348 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  37.5 
 
 		 348 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  40.68 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2479  resolvase helix-turn-helix domain protein  43.4 
 
 		 298 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.883551  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0241  transposase  32.35 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000404674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  43.24 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  34.85 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  34.85 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 		 178 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  39.66 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  47.5 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  35.82 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  50 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  50 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  50 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  36.51 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  50 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  50 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  50 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3635  putative transposase  38.1 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  39.66 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  39.66 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  39.66 
 
 		 355 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  45.95 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  45.95 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.85 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  38.98 
 
 		 345 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  45.95 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.85 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6559  hypothetical protein  77.27 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.85 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.85 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3220  hypothetical protein  31.88 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.85 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.85 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.85 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  43.24 
 
 		 256 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 		 173 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  33.85 
 
 		 169 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  45.95 
 
 		 187 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  40.54 
 
 		 108 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  40.54 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  40.54 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  40.54 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  40.54 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  40.54 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  36.51 
 
 		 319 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  43.24 
 
 		 356 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  43.24 
 
 		 356 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1451  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.65 
 
 		 333 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00474  transposase  40.54 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  43.24 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  43.24 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  40.54 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  31.82 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 353 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>