194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3006 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0070  IS630 family transposase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3006  IS630 family transposase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3071  IS630 family transposase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.724301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6340  IS630 family transposase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7158  IS630 family transposase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.966383  normal  0.0630141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3167  IS630 family transposase  99.51 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4437  IS630 family transposase  99.51 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1869  hypothetical protein  70.3 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557561  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0117  IS630 family transposase  51.01 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4112  IS630 family transposase  51.01 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8269  hypothetical protein  53.48 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3885  IS630 family transposase  46.5 
 
 		 191 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00204873  normal  0.0220373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2883  hypothetical protein  63.64 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000785138  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6778  hypothetical protein  77.19 
 
 		 111 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0416  hypothetical protein  72.73 
 
 		 102 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0191  IS630 family transposase  53.09 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  27.96 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  30.89 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3635  putative transposase  26.34 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6559  hypothetical protein  36.36 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  29.8 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.86 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.86 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.86 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.86 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.86 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  30.3 
 
 		 352 aa  65.1  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.86 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.86 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  25 
 
 		 342 aa  64.7  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  25 
 
 		 342 aa  64.7  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  25 
 
 		 342 aa  64.7  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  30.98 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  29.79 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  23.86 
 
 		 350 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  28.79 
 
 		 352 aa  61.6  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  29.29 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  29.84 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  25.41 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  25.41 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  25.41 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  29.84 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  25.53 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  25.53 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  25.53 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  25.53 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  23.35 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  30.43 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  30.27 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  24.18 
 
 		 345 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  31.51 
 
 		 332 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4995  hypothetical protein  28.27 
 
 		 292 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3589  hypothetical protein  28.27 
 
 		 292 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.303054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  31.51 
 
 		 332 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  26.42 
 
 		 350 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  22.58 
 
 		 344 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  26.62 
 
 		 348 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  23.26 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  30.38 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  23.89 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  21.76 
 
 		 352 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  34.44 
 
 		 168 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  24.21 
 
 		 352 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  21.76 
 
 		 347 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  21.76 
 
 		 352 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  21.76 
 
 		 352 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  21.76 
 
 		 352 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  23.98 
 
 		 168 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  24.42 
 
 		 294 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  24.42 
 
 		 294 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  24.42 
 
 		 294 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  24.42 
 
 		 294 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  24.42 
 
 		 294 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  26.32 
 
 		 348 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  26.32 
 
 		 348 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  31.17 
 
 		 322 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  23.89 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  23.89 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  26.32 
 
 		 348 aa  48.5  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  26.32 
 
 		 348 aa  48.5  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  41.18 
 
 		 319 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  23.68 
 
 		 352 aa  48.5  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>