More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1527 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1527  imidazolonepropionase  100 
 
 
397 aa  805    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000197969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0211  imidazolonepropionase  55.61 
 
 
398 aa  448  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.85766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  44.09 
 
 
423 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  38 
 
 
412 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  38 
 
 
412 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  42.94 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  42.94 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  42.94 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  42.65 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  42.65 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  42.65 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  42.65 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  42.65 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  42.65 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  42.65 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  38.97 
 
 
424 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  39.03 
 
 
424 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  37.78 
 
 
423 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  37.15 
 
 
411 aa  255  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  37.6 
 
 
428 aa  243  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
414 aa  243  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  37.04 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  33.17 
 
 
427 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  35.71 
 
 
410 aa  236  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  36.52 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  34.42 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  36.93 
 
 
413 aa  234  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  36.21 
 
 
408 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  36.18 
 
 
408 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  35.9 
 
 
423 aa  232  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  35.43 
 
 
408 aa  232  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  36.47 
 
 
408 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  31.51 
 
 
411 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  36.47 
 
 
408 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  36.47 
 
 
408 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  35.9 
 
 
408 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  35.9 
 
 
408 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  35.9 
 
 
408 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  36.47 
 
 
408 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  36.47 
 
 
410 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  37.53 
 
 
429 aa  229  9e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
429 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  35.14 
 
 
403 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  35.06 
 
 
412 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  33.8 
 
 
402 aa  225  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
401 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  34.29 
 
 
416 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  33.52 
 
 
410 aa  223  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  32.96 
 
 
401 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  34.25 
 
 
426 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  33.24 
 
 
401 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  33.82 
 
 
401 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  32.96 
 
 
401 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  33.14 
 
 
403 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  33.24 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  32.11 
 
 
421 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  33.24 
 
 
402 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  32.66 
 
 
416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1634  imidazolonepropionase  35.69 
 
 
411 aa  215  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  32.01 
 
 
421 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  32.94 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  32.86 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0655  imidazolonepropionase  34.9 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  32.17 
 
 
421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  32.95 
 
 
402 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  32.03 
 
 
411 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  32.29 
 
 
416 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  32.03 
 
 
411 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  32.76 
 
 
425 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1545  imidazolonepropionase  34 
 
 
416 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0601909  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  32.29 
 
 
403 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  32.09 
 
 
431 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4272  imidazolonepropionase  35.57 
 
 
414 aa  209  8e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  30.4 
 
 
402 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  34.04 
 
 
424 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  32.99 
 
 
415 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  30.05 
 
 
414 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  32.76 
 
 
407 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  35.8 
 
 
395 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  34.19 
 
 
400 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  33.82 
 
 
418 aa  206  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  33.14 
 
 
445 aa  206  8e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  32.69 
 
 
415 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  32.12 
 
 
410 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  32.39 
 
 
408 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  32.12 
 
 
395 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  32.66 
 
 
405 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  32.58 
 
 
405 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  31.52 
 
 
406 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  30.56 
 
 
406 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  30.56 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  30.75 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  32.19 
 
 
403 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  30.92 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  30.92 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  30.92 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  30.92 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  30.92 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  31.04 
 
 
399 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>